Программа для оценки качества построения имунных репертуаров антител (IgQUAST)

Программа разработана для применения в иммуноинформатике и предназначена для оценки качества построения иммунных репертуаров. Работает в двух режимах: «с референсом» и «без референса». В режиме с референсом программа принимает на вход два иммунных репертуара, анализируемый и референсный, построенные по одной библиотеке иммуносеквенирования (Rep-seq), сравнивает анализируемый репертуар с референсным и выводит числовые статистики и графики сравнения. В режиме без референса программа принимает на вход только анализируемый репертуар, для которого определяет потенциально ошибочные иммунные последовательности, используя статистическую модель ошибок секвенирования. Также в этом режиме программа оценивает параметры качества исходной Rep-seq библиотеки: распределение количества ошибок в ридах и их распределение вдоль рида (профиль ошибок).